La transition est brutale car elle est coopérative, elle est réversible et se reconstitue quand la température baisse, cette propriété est utilisé aux puces d'ADN , capables de reconnaître par hybridation des séquences définies d'ADN présentes aux solutions en très faibles quantités. On peut utiliser le degraffage de l'ADN à l'échelle de la molécule en passant un des deux brins par la suite dans un pore nanometrique.
L'ADN est chargée électriquement c'est un polyelectrolyte,un fil chargée électriquement comme l'ADN crée autour de lui un potentiel electrostatique très profond aux courtes distances qui piègent des ions comme le sodium provoquant la solidité de l'ADN
Le mécanisme de compactation est electrostatique et les enzymes appelés topo-isomerases enroulent l'ADN, artificiellement on l'obtient avec un petit aimant qui tourne autour d'une bille fixée à l'ADN pour éviter des noeuds qui provoquerait la mort de la cellule